Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms