Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Top2aQ01320 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms