Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja5Q01231 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms