Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga4Q00651 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms