Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms