Protein–RNA interactions for Protein: P97817

Cdr2, Cerebellar degeneration-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr2P97817 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms