Protein–RNA interactions for Protein: P97812

Ihh, Indian hedgehog protein, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IhhP97812 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IhhP97812 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IhhP97812 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IhhP97812 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IhhP97812 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IhhP97812 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IhhP97812 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IhhP97812 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IhhP97812 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IhhP97812 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IhhP97812 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IhhP97812 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IhhP97812 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IhhP97812 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IhhP97812 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IhhP97812 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IhhP97812 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IhhP97812 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IhhP97812 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IhhP97812 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IhhP97812 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IhhP97812 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IhhP97812 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IhhP97812 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IhhP97812 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IhhP97812 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IhhP97812 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IhhP97812 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IhhP97812 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IhhP97812 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IhhP97812 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IhhP97812 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IhhP97812 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IhhP97812 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IhhP97812 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IhhP97812 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IhhP97812 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IhhP97812 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IhhP97812 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IhhP97812 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IhhP97812 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IhhP97812 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IhhP97812 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IhhP97812 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IhhP97812 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IhhP97812 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IhhP97812 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IhhP97812 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IhhP97812 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IhhP97812 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IhhP97812 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IhhP97812 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IhhP97812 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IhhP97812 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IhhP97812 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IhhP97812 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IhhP97812 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IhhP97812 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IhhP97812 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IhhP97812 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IhhP97812 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IhhP97812 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IhhP97812 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IhhP97812 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IhhP97812 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IhhP97812 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IhhP97812 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IhhP97812 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IhhP97812 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IhhP97812 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IhhP97812 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IhhP97812 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IhhP97812 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IhhP97812 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IhhP97812 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IhhP97812 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IhhP97812 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IhhP97812 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IhhP97812 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IhhP97812 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IhhP97812 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IhhP97812 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IhhP97812 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IhhP97812 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IhhP97812 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IhhP97812 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IhhP97812 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IhhP97812 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IhhP97812 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IhhP97812 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IhhP97812 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IhhP97812 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IhhP97812 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IhhP97812 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IhhP97812 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IhhP97812 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IhhP97812 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IhhP97812 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IhhP97812 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IhhP97812 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms