Protein–RNA interactions for Protein: P97797

Sirpa, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type substrate 1, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SirpaP97797 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SirpaP97797 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SirpaP97797 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SirpaP97797 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SirpaP97797 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SirpaP97797 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SirpaP97797 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SirpaP97797 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SirpaP97797 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SirpaP97797 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SirpaP97797 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SirpaP97797 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SirpaP97797 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SirpaP97797 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SirpaP97797 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SirpaP97797 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SirpaP97797 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SirpaP97797 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SirpaP97797 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SirpaP97797 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SirpaP97797 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SirpaP97797 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SirpaP97797 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SirpaP97797 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SirpaP97797 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SirpaP97797 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SirpaP97797 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SirpaP97797 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SirpaP97797 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SirpaP97797 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SirpaP97797 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SirpaP97797 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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