Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AlkP97793 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AlkP97793 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AlkP97793 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AlkP97793 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AlkP97793 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AlkP97793 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AlkP97793 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
AlkP97793 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AlkP97793 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
AlkP97793 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AlkP97793 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
AlkP97793 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AlkP97793 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
AlkP97793 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
AlkP97793 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AlkP97793 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AlkP97793 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AlkP97793 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AlkP97793 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AlkP97793 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AlkP97793 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AlkP97793 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
AlkP97793 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AlkP97793 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AlkP97793 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AlkP97793 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AlkP97793 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AlkP97793 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AlkP97793 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
AlkP97793 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AlkP97793 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AlkP97793 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AlkP97793 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AlkP97793 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AlkP97793 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AlkP97793 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AlkP97793 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AlkP97793 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AlkP97793 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AlkP97793 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AlkP97793 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
AlkP97793 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AlkP97793 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AlkP97793 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
AlkP97793 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AlkP97793 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AlkP97793 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AlkP97793 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AlkP97793 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AlkP97793 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AlkP97793 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AlkP97793 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AlkP97793 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AlkP97793 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AlkP97793 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AlkP97793 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AlkP97793 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AlkP97793 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
AlkP97793 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AlkP97793 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AlkP97793 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AlkP97793 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AlkP97793 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AlkP97793 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AlkP97793 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AlkP97793 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AlkP97793 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AlkP97793 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AlkP97793 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AlkP97793 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AlkP97793 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AlkP97793 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
AlkP97793 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AlkP97793 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AlkP97793 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
AlkP97793 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AlkP97793 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AlkP97793 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AlkP97793 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AlkP97793 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AlkP97793 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AlkP97793 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AlkP97793 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AlkP97793 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AlkP97793 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AlkP97793 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AlkP97793 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC21.32■■□□□ 1
AlkP97793 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AlkP97793 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC21.32■■□□□ 1
AlkP97793 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AlkP97793 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AlkP97793 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AlkP97793 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AlkP97793 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AlkP97793 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AlkP97793 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AlkP97793 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
AlkP97793 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AlkP97793 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms