Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
rp9P97762 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
rp9P97762 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
rp9P97762 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
rp9P97762 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
rp9P97762 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
rp9P97762 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
rp9P97762 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
rp9P97762 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
rp9P97762 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
rp9P97762 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
rp9P97762 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
rp9P97762 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
rp9P97762 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
rp9P97762 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
rp9P97762 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
rp9P97762 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
rp9P97762 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
rp9P97762 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
rp9P97762 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
rp9P97762 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
rp9P97762 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
rp9P97762 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
rp9P97762 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
rp9P97762 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
rp9P97762 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
rp9P97762 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
rp9P97762 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
rp9P97762 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
rp9P97762 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
rp9P97762 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
rp9P97762 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
rp9P97762 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
rp9P97762 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
rp9P97762 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
rp9P97762 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
rp9P97762 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
rp9P97762 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
rp9P97762 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
rp9P97762 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
rp9P97762 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
rp9P97762 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
rp9P97762 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
rp9P97762 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
rp9P97762 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
rp9P97762 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
rp9P97762 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
rp9P97762 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
rp9P97762 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
rp9P97762 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
rp9P97762 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
rp9P97762 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
rp9P97762 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
rp9P97762 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
rp9P97762 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
rp9P97762 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
rp9P97762 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
rp9P97762 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
rp9P97762 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
rp9P97762 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
rp9P97762 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
rp9P97762 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
rp9P97762 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
rp9P97762 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
rp9P97762 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
rp9P97762 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
rp9P97762 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
rp9P97762 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
rp9P97762 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
rp9P97762 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
rp9P97762 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
rp9P97762 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
rp9P97762 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
rp9P97762 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
rp9P97762 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
rp9P97762 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
rp9P97762 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
rp9P97762 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
rp9P97762 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
rp9P97762 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
rp9P97762 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
rp9P97762 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
rp9P97762 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
rp9P97762 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
rp9P97762 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
rp9P97762 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
rp9P97762 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
rp9P97762 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
rp9P97762 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
rp9P97762 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
rp9P97762 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
rp9P97762 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
rp9P97762 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
rp9P97762 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
rp9P97762 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
rp9P97762 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
rp9P97762 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
rp9P97762 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
rp9P97762 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
rp9P97762 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms