Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mesp1P97309 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms