Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vgll3P85442 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms