Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tubg1P83887 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tubg1P83887 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tubg1P83887 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tubg1P83887 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tubg1P83887 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tubg1P83887 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tubg1P83887 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tubg1P83887 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tubg1P83887 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tubg1P83887 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tubg1P83887 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tubg1P83887 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tubg1P83887 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tubg1P83887 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tubg1P83887 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tubg1P83887 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tubg1P83887 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tubg1P83887 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms