Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad1P70340 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad1P70340 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad1P70340 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad1P70340 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smad1P70340 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smad1P70340 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smad1P70340 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad1P70340 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad1P70340 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad1P70340 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms