Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sycp3P70281 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms