Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrig1P70193 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.4 ms