Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rps29P62274 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rps29P62274 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Rps29P62274 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Rps29P62274 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Rps29P62274 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Rps29P62274 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms