Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga11P61622 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga11P61622 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga11P61622 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga11P61622 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga11P61622 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga11P61622 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms