Protein–RNA interactions for Protein: P61164

Actr1a, Alpha-centractin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actr1aP61164 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Actr1aP61164 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Actr1aP61164 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Actr1aP61164 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Actr1aP61164 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Actr1aP61164 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms