Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snap25P60879 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snap25P60879 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snap25P60879 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snap25P60879 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snap25P60879 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms