Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rin3P59729 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rin3P59729 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rin3P59729 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rin3P59729 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rin3P59729 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rin3P59729 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rin3P59729 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rin3P59729 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rin3P59729 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rin3P59729 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms