Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hps5P59438 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hps5P59438 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hps5P59438 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hps5P59438 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hps5P59438 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hps5P59438 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hps5P59438 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hps5P59438 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Hps5P59438 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hps5P59438 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hps5P59438 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hps5P59438 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hps5P59438 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hps5P59438 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hps5P59438 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hps5P59438 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hps5P59438 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hps5P59438 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hps5P59438 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hps5P59438 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hps5P59438 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hps5P59438 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hps5P59438 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hps5P59438 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hps5P59438 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hps5P59438 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hps5P59438 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hps5P59438 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hps5P59438 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hps5P59438 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hps5P59438 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Hps5P59438 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hps5P59438 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hps5P59438 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hps5P59438 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hps5P59438 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hps5P59438 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hps5P59438 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hps5P59438 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hps5P59438 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hps5P59438 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hps5P59438 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hps5P59438 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hps5P59438 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hps5P59438 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hps5P59438 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hps5P59438 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hps5P59438 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hps5P59438 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hps5P59438 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hps5P59438 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hps5P59438 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hps5P59438 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hps5P59438 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Hps5P59438 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hps5P59438 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hps5P59438 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hps5P59438 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hps5P59438 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hps5P59438 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Hps5P59438 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hps5P59438 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hps5P59438 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hps5P59438 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hps5P59438 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hps5P59438 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hps5P59438 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hps5P59438 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hps5P59438 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hps5P59438 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hps5P59438 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hps5P59438 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hps5P59438 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hps5P59438 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hps5P59438 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hps5P59438 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hps5P59438 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hps5P59438 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Hps5P59438 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hps5P59438 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Hps5P59438 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Hps5P59438 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hps5P59438 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hps5P59438 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hps5P59438 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hps5P59438 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hps5P59438 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hps5P59438 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hps5P59438 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hps5P59438 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hps5P59438 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hps5P59438 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hps5P59438 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hps5P59438 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hps5P59438 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hps5P59438 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hps5P59438 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hps5P59438 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hps5P59438 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms