Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms