Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irf5P56477 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irf5P56477 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irf5P56477 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irf5P56477 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irf5P56477 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irf5P56477 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Irf5P56477 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irf5P56477 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Irf5P56477 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irf5P56477 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irf5P56477 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irf5P56477 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irf5P56477 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irf5P56477 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Irf5P56477 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irf5P56477 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irf5P56477 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irf5P56477 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irf5P56477 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irf5P56477 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irf5P56477 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irf5P56477 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irf5P56477 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irf5P56477 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irf5P56477 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irf5P56477 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irf5P56477 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irf5P56477 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irf5P56477 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irf5P56477 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irf5P56477 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irf5P56477 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irf5P56477 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irf5P56477 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irf5P56477 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irf5P56477 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irf5P56477 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irf5P56477 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irf5P56477 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irf5P56477 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irf5P56477 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irf5P56477 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irf5P56477 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irf5P56477 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irf5P56477 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irf5P56477 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irf5P56477 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irf5P56477 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irf5P56477 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irf5P56477 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irf5P56477 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irf5P56477 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irf5P56477 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Irf5P56477 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irf5P56477 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irf5P56477 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irf5P56477 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irf5P56477 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irf5P56477 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irf5P56477 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irf5P56477 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irf5P56477 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irf5P56477 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irf5P56477 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irf5P56477 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irf5P56477 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irf5P56477 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irf5P56477 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Irf5P56477 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Irf5P56477 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Irf5P56477 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Irf5P56477 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Irf5P56477 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Irf5P56477 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Irf5P56477 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irf5P56477 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irf5P56477 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irf5P56477 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irf5P56477 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irf5P56477 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Irf5P56477 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irf5P56477 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irf5P56477 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irf5P56477 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irf5P56477 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irf5P56477 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irf5P56477 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Irf5P56477 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irf5P56477 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irf5P56477 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irf5P56477 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irf5P56477 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irf5P56477 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irf5P56477 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Irf5P56477 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Irf5P56477 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Irf5P56477 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irf5P56477 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irf5P56477 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms