Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms