Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Sh3bp1P55194 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Sh3bp1P55194 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms