Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rad23aP54726 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms