Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms