Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PctpP53808 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PctpP53808 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PctpP53808 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PctpP53808 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PctpP53808 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PctpP53808 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PctpP53808 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PctpP53808 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PctpP53808 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PctpP53808 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PctpP53808 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PctpP53808 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PctpP53808 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PctpP53808 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PctpP53808 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PctpP53808 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PctpP53808 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PctpP53808 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PctpP53808 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PctpP53808 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PctpP53808 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PctpP53808 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PctpP53808 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PctpP53808 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PctpP53808 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PctpP53808 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PctpP53808 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PctpP53808 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PctpP53808 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PctpP53808 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PctpP53808 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PctpP53808 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PctpP53808 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PctpP53808 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PctpP53808 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PctpP53808 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PctpP53808 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PctpP53808 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PctpP53808 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PctpP53808 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PctpP53808 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PctpP53808 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PctpP53808 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PctpP53808 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PctpP53808 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PctpP53808 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PctpP53808 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PctpP53808 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PctpP53808 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PctpP53808 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PctpP53808 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PctpP53808 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PctpP53808 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PctpP53808 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PctpP53808 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PctpP53808 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PctpP53808 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PctpP53808 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PctpP53808 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PctpP53808 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PctpP53808 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PctpP53808 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PctpP53808 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PctpP53808 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PctpP53808 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PctpP53808 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PctpP53808 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PctpP53808 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PctpP53808 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PctpP53808 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PctpP53808 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PctpP53808 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PctpP53808 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PctpP53808 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PctpP53808 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PctpP53808 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PctpP53808 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PctpP53808 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PctpP53808 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PctpP53808 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PctpP53808 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PctpP53808 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PctpP53808 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PctpP53808 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PctpP53808 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PctpP53808 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PctpP53808 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PctpP53808 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PctpP53808 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PctpP53808 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PctpP53808 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PctpP53808 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PctpP53808 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PctpP53808 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PctpP53808 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PctpP53808 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PctpP53808 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PctpP53808 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PctpP53808 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms