Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClgnP52194 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClgnP52194 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ClgnP52194 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClgnP52194 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClgnP52194 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ClgnP52194 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms