Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apobec1P51908 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms