Protein–RNA interactions for Protein: P50586

Tub, Tubby protein, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TubP50586 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TubP50586 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TubP50586 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TubP50586 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TubP50586 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TubP50586 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TubP50586 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TubP50586 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TubP50586 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TubP50586 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TubP50586 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TubP50586 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TubP50586 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TubP50586 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TubP50586 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TubP50586 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TubP50586 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TubP50586 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TubP50586 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TubP50586 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TubP50586 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TubP50586 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TubP50586 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TubP50586 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TubP50586 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TubP50586 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TubP50586 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TubP50586 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TubP50586 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TubP50586 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TubP50586 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TubP50586 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TubP50586 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TubP50586 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TubP50586 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TubP50586 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TubP50586 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TubP50586 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TubP50586 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TubP50586 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TubP50586 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TubP50586 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TubP50586 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TubP50586 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TubP50586 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TubP50586 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TubP50586 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TubP50586 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TubP50586 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TubP50586 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TubP50586 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TubP50586 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TubP50586 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TubP50586 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TubP50586 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TubP50586 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TubP50586 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TubP50586 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TubP50586 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TubP50586 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TubP50586 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TubP50586 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TubP50586 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TubP50586 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TubP50586 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TubP50586 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TubP50586 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TubP50586 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TubP50586 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TubP50586 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TubP50586 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TubP50586 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TubP50586 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TubP50586 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TubP50586 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TubP50586 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TubP50586 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TubP50586 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TubP50586 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TubP50586 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TubP50586 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TubP50586 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TubP50586 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TubP50586 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TubP50586 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TubP50586 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TubP50586 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TubP50586 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TubP50586 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TubP50586 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TubP50586 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TubP50586 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TubP50586 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TubP50586 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TubP50586 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TubP50586 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TubP50586 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TubP50586 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TubP50586 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TubP50586 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms