Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BckdhaP50136 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms