Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmod1P49813 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms