Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
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PtpreP49446 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtpreP49446 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtpreP49446 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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PtpreP49446 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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PtpreP49446 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtpreP49446 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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PtpreP49446 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtpreP49446 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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PtpreP49446 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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PtpreP49446 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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PtpreP49446 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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PtpreP49446 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PtpreP49446 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtpreP49446 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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