Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnni3P48787 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms