Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrprbP47758 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrprbP47758 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrprbP47758 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrprbP47758 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrprbP47758 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrprbP47758 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrprbP47758 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrprbP47758 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms