Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab11bP46638 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms