Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf1P46099 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf1P46099 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf1P46099 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf1P46099 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf1P46099 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf1P46099 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf1P46099 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms