Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syt1P46096 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syt1P46096 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syt1P46096 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syt1P46096 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syt1P46096 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms