Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ItgavP43406 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ItgavP43406 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ItgavP43406 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ItgavP43406 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ItgavP43406 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ItgavP43406 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ItgavP43406 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ItgavP43406 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ItgavP43406 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ItgavP43406 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms