Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlx1P43345 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms