Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkx1-2P42580 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms