Protein–RNA interactions for Protein: P40124

Cap1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cap1P40124 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cap1P40124 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cap1P40124 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cap1P40124 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cap1P40124 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cap1P40124 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cap1P40124 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cap1P40124 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cap1P40124 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cap1P40124 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cap1P40124 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cap1P40124 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cap1P40124 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cap1P40124 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cap1P40124 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cap1P40124 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cap1P40124 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms