Protein–RNA interactions for Protein: P39688

Fyn, Tyrosine-protein kinase Fyn, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FynP39688 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FynP39688 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FynP39688 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FynP39688 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FynP39688 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FynP39688 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FynP39688 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FynP39688 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FynP39688 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FynP39688 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FynP39688 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FynP39688 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FynP39688 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FynP39688 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FynP39688 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FynP39688 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FynP39688 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FynP39688 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FynP39688 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FynP39688 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FynP39688 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FynP39688 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FynP39688 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FynP39688 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FynP39688 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FynP39688 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FynP39688 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FynP39688 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FynP39688 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FynP39688 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FynP39688 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FynP39688 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FynP39688 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FynP39688 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FynP39688 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FynP39688 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FynP39688 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FynP39688 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FynP39688 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FynP39688 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FynP39688 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FynP39688 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FynP39688 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FynP39688 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FynP39688 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FynP39688 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FynP39688 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FynP39688 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FynP39688 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FynP39688 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FynP39688 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FynP39688 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FynP39688 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FynP39688 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FynP39688 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FynP39688 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FynP39688 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FynP39688 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FynP39688 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FynP39688 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FynP39688 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FynP39688 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FynP39688 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FynP39688 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FynP39688 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FynP39688 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FynP39688 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FynP39688 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FynP39688 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FynP39688 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FynP39688 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FynP39688 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FynP39688 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FynP39688 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FynP39688 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FynP39688 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FynP39688 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FynP39688 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FynP39688 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FynP39688 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FynP39688 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FynP39688 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FynP39688 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FynP39688 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
FynP39688 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FynP39688 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FynP39688 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FynP39688 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FynP39688 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FynP39688 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FynP39688 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FynP39688 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FynP39688 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FynP39688 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FynP39688 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FynP39688 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FynP39688 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FynP39688 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FynP39688 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FynP39688 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms