Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Traf1P39428 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Traf1P39428 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf1P39428 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf1P39428 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf1P39428 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf1P39428 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf1P39428 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf1P39428 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf1P39428 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf1P39428 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf1P39428 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms