Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TtlP38585 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TtlP38585 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TtlP38585 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TtlP38585 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TtlP38585 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TtlP38585 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TtlP38585 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TtlP38585 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TtlP38585 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TtlP38585 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TtlP38585 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TtlP38585 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TtlP38585 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TtlP38585 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TtlP38585 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TtlP38585 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TtlP38585 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TtlP38585 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TtlP38585 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TtlP38585 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TtlP38585 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TtlP38585 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TtlP38585 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TtlP38585 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TtlP38585 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TtlP38585 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TtlP38585 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TtlP38585 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TtlP38585 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TtlP38585 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TtlP38585 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TtlP38585 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TtlP38585 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TtlP38585 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TtlP38585 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
TtlP38585 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
TtlP38585 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TtlP38585 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TtlP38585 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TtlP38585 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TtlP38585 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TtlP38585 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TtlP38585 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
TtlP38585 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
TtlP38585 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TtlP38585 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TtlP38585 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TtlP38585 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TtlP38585 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
TtlP38585 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TtlP38585 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
TtlP38585 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TtlP38585 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TtlP38585 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TtlP38585 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TtlP38585 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TtlP38585 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TtlP38585 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TtlP38585 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TtlP38585 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TtlP38585 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TtlP38585 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TtlP38585 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TtlP38585 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TtlP38585 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TtlP38585 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TtlP38585 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TtlP38585 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TtlP38585 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TtlP38585 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TtlP38585 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TtlP38585 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TtlP38585 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TtlP38585 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TtlP38585 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TtlP38585 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TtlP38585 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TtlP38585 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TtlP38585 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
TtlP38585 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TtlP38585 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TtlP38585 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TtlP38585 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
TtlP38585 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TtlP38585 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TtlP38585 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TtlP38585 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TtlP38585 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TtlP38585 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TtlP38585 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TtlP38585 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TtlP38585 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TtlP38585 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TtlP38585 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TtlP38585 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TtlP38585 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TtlP38585 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TtlP38585 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TtlP38585 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms