Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lig1P37913 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lig1P37913 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lig1P37913 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lig1P37913 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lig1P37913 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lig1P37913 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lig1P37913 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms