Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hoxc10P31257 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms