Protein–RNA interactions for Protein: P31240

Pdgfb, Platelet-derived growth factor subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfbP31240 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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PdgfbP31240 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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PdgfbP31240 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfbP31240 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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